序一序二自叙卷首 十二经络图象手太阴肺经图手阳明大肠经图足阳明胃经图足太阴脾经图手少阴心经图手太阳小肠经图足太阳膀胱经图足少阴肾经图心包络经图三焦经图足少阳胆经图足厥阴肝经图卷上肺经第一大肠经第二胃经
妇科百辩
自序卷一·温病方论春温集补证治并方附：风温附：冬温附：温疟附：温毒发斑附：医案三则春温病论温热病脉论温病方五道附：集方二十九道卷二·热病方论夏热集补证治并方总论温热死脉死证附：湿温附：阳毒发斑附：阴毒
正文太虚理气天地阴阳歌五行质气生克制化歌运气合脏腑十二经络歌主运歌主气歌客运歌客气司天在泉间气歌运气分主节令歌五音主客太少相生歌五运齐化兼化六气正化对化歌六十年运气上下相临歌起主客定位指掌歌天符太乙天
简介序正文
简介序卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七卷八卷九跋
自叙凡例卷一中风类中伤风中寒伤寒劳复、食复、女劳复、阴阳易卷二温热病瘟疫大头瘟暑湿消渴火霍乱泄泻伤食不食卷三疟痢疟痢呃逆厥痉疝气冲眩晕卷四虚损痨瘵恶寒发热血证衄血下血溺血汗卷五七情喜怒忧思悲恐惊郁诈病
卷一九针原始歌九针式图并九针主治法歌行针次第手法歌行针分寸法歌十二经井荥俞经合原刺浅深歌五脏井荥俞经合歌六腑井荥俞原经合歌十二经表里原络总歌肺经表里原络穴主治歌大肠经表里原络穴主治歌脾经表里原络穴主治
叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一
序卷一初诞法护养法噤风撮口脐风脉法变蒸肝脏心脏脾脏肺脏肾脏卷二面上症发搐目睛动唇口蠕动惊搐目直睡中惊动目动咬牙摇头便血偏风口噤角弓反张卷三急惊慢惊惊痫惊风天钓内钓盘肠气痛胎惊胎风五软五硬卷四风热风症痉