绪言第一卷温热总论论温热四时皆有（添加）论温热五种辨法论温热与风寒各异论温热伏气与新感不同（添加）论温热即是伏火（添加）论湿火之症治论燥火之症治论温热本症疗法（添加）论温热兼症疗法其一兼风其二兼寒其三
自序凡例卷上寒总论肾虚人易犯伤寒论不服药为中医论两感论时行疫症伤寒十六症类伤寒六症内伤外感辨治伤寒宜早视伤寒宜详辨成氏再传之讹六经七日病愈论仲景三百九十七法一百一十三方论陶氏辨差认十六条察色法察目法察
序各论人参防党参西洋参北沙参甘草黄精葳蕤黄芪白术苍术桔梗天麻秦艽柴胡前胡独活羌活防风升麻细辛远志金毛狗脊淫羊藿锁阳肉苁蓉白芨三七地榆丹参元参苦参龙胆草黄连胡黄连黄芩紫草知母贝母白头翁白前白薇白鲜皮白茅
年序曹序胡序张序姚序目论目议外障外障治法内障内障治法小儿痘毒眼治法小儿疳积眼治法治小儿雀目法附刻薛氏选方
石山医案
医垒元戎
裘序叶序原序卷上辨春夏秋冬温暑凉寒四证病原天时地气辨寒暑证各异暑证暑厥暑风暑疡暑瘵绞肠痧时疫（见朱丹溪）寒疫脉理五运六气五运配十干之年六气为司天之岁南政北政十二支年分运气增订客气客运活法卷中古今名医暑
卷一明目赋（一）眼科论孙真人谕眼论阴阳相应辨论上古天真论眼科通明论轩辕黄帝说眼病目科四季五行发挥妙诀明目赋（二）太玄真人论眼病五轮所属太玄真人问眼病因论八廓所属八卦也论五轮受病之因论八廓受实热病之因论
注序补注《明医杂着》序卷之一仲景东垣河间丹溪诸书孰优处方药品多少论异法方宜论丹溪治病不出乎气血痰郁产后发热伤寒时气病后调养泄泻劳热饮食劳倦内伤发热伤寒发热伤暑发热病有感伤中心腹疼痛病时静心息虑发热论补
卷上痘疹发微惊风卷中论望色论芤脉论人参论***杂记卷下三疟治验神水治验制神水秘法妇科验方